Tại Thông tư này, Bộ Tài chính bổ sung quy định về việc thu phí công bố nội dung đăng ký doanh nghiệp. Theo đó, Trung tâm hỗ trợ nghiệp vụ đăng ký doanh nghiệp thuộc cục Quản lý đăng ký kinh doanh (Bộ Kế hoạch và Đầu tư); Phòng Đăng ký kinh doanh cấp tỉnh là cơ quan tiếp nhận yêu cầu và thu phí công bố nội dung đăng ký doanh nghiệp; mức phí là 300.000 đồng/lần.
Về quản lý, sử dụng phí công bố nội dung đăng ký doanh nghiệp, Bộ cũng chỉ rõ, trường hợp Trung tâm hỗ trợ nghiệp vụ đăng ký kinh doanh tiếp nhận yêu cầu và thu phí thì Trung tâm được trích lại 90% số tiền phí thu được trước khi nộp vào ngân sách Nhà nước; trường hợp Phòng đăng ký kinh doanh cấp tỉnh tiếp nhận yêu cầu và thu phí thì được trích 30% số phí thu được, phần còn lại phải chuyển về Trung tâm Hỗ trợ nghiệp vụ đăng ký kinh doanh, khi đó, Trung tâm trích tiếp 60% số phí thu được và nộp ngân sách Nhà nước 10%.
Quy định về các loại phí và lệ phí đăng ký doanh nghiệp khác vẫn giữ nguyên theo quy định hiện hành.
Thông tư này có hiệu lực thi hành từ ngày 01/10/2013.