Công văn 1216/CTHGI-TTHT về hướng dẫn chính sách thuế

Cục Thuế nhận được công văn số 120/ĐN-BTĐB ngày 01/11/2024 của Ban Quản lý dự án Bảo trì đường bộ về việc hướng dẫn nộp thuế theo quy định với đơn vị sự nghiệp công lập. Về vấn đề này, Cục Thuế có ý kiến như sau:

1. Thuế GTGT

- Tại khoản 1, Điều 12 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn về thuế giá trị gia tăng và Nghị định số 209/2013/NĐ-CP ngày 18/12/2013 của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều Luật Thuế giá trị gia tăng quy định:

“Điều 12. Phương pháp khấu trừ thuế

1. Phương pháp khấu trừ thuế áp dụng đối với cơ sở kinh doanh thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật về kế toán, hóa đơn, chứng từ bao gồm:

a) Cơ sở kinh doanh đang hoạt động có doanh thu hàng năm từ bán hàng hóa, cung ứng dịch vụ từ một tỷ đồng trở lên và thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật về kế toán, hóa đơn, chứng từ, trừ hộ, cá nhân kinh doanh nộp thuế theo phương pháp tính trực tiếp hướng dẫn tại Điều 13 Thông tư này;

b) Cơ sở kinh doanh đăng ký tự nguyện áp dụng phương pháp khấu trừ thuế, trừ hộ, cá nhân kinh doanh nộp thuế theo phương pháp tính trực tiếp hướng dẫn tại Điều 13 Thông tư này;

…”

- Tại khoản 2, Điều 13 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính quy định.

“Điều 13. Phương pháp tính trực tiếp trên giá trị gia tăng

2. Số thuế giá trị gia tăng phải nộp theo phương pháp tính trực tiếp trên giá trị gia tăng bằng tỷ lệ % nhân với doanh thu áp dụng như sau:

a) Đối tượng áp dụng:

…

- Tổ chức kinh tế khác không phải là doanh nghiệp, hợp tác xã, trừ trường hợp đăng ký nộp thuế theo phương pháp khấu trừ.

b) Tỷ lệ % để tính thuế GTGT trên doanh thu được quy định theo từng hoạt động như sau:

- Phân phối, cung cấp hàng hóa: 1%;

- Dịch vụ, xây dựng không bao thầu nguyên vật liệu: 5%;

- Sản xuất, vận tải, dịch vụ có gắn với hàng hóa, xây dựng có bao thầu nguyên vật liệu: 3%;

- Hoạt động kinh doanh khác: 2%.”

2. Thuế TNDN

- Tại khoản 1, khoản 5, Điều 3 Thông tư số 78/2014/TT-BTC ngày 18/6/2014 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 218/2013/NĐ-CP ngày 26/12/2013 của Chính phủ quy định và hướng dẫn thi hành Luật thuế thu nhập doanh nghiệp quy định:

“Điều 3. Phương pháp tính thuế

1. Số thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp trong kỳ tính thuế bằng thu nhập tính thuế nhân với thuế suất.

Thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp được xác định theo công thức sau:

Thuế TNDNphải nộp = (Thu nhập tính thuế - Phần trích lập quỹ KH&CN (nếu có)) x Thuế suất thuế TNDN

…

5. Đơn vị sự nghiệp, tổ chức khác không phải là doanh nghiệp thành lập và hoạt động theo quy định của pháp luật Việt Nam, doanh nghiệp nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp trực tiếp có hoạt động kinh doanh hàng hóa, dịch vụ có thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp mà các đơn vị này xác định được doanh thu nhưng không xác định được chi phí, thu nhập của hoạt động kinh doanh thì kê khai nộp thuế thu nhập doanh nghiệp tính theo tỷ lệ % trên doanh thu bán hàng hóa, dịch vụ, cụ thể như sau:

+ Đối với dịch vụ (bao gồm cả lãi tiền gửi, lãi tiền cho vay): 5%.

Riêng hoạt động giáo dục, y tế, biểu diễn nghệ thuật: 2%.

+ Đối với kinh doanh hàng hóa: 1%.

+ Đối với hoạt động khác: 2%.”

3. Lệ phí Môn Bài

• Tại Điều 2, Nghị định số 139/2016/NĐ-CP ngày 4/10/2016 của Chính phủ quy định về người nộp lệ phí môn bài quy định:

“Điều 2. Người nộp lệ phí môn bài

Người nộp lệ phí môn bài là tổ chức, cá nhân hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ, trừ trường hợp quy định tại Điều 3 Nghị định này, bao gồm:

…

3. Đơn vị sự nghiệp được thành lập theo quy định của pháp luật. ”

Đối chiếu các quy định, Ban Quản lý dự án Bảo trì đường bộ là đơn vị sự nghiệp công lập (không phải là doanh nghiệp, hợp tác xã) có hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ nếu thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, sổ sách, hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật về kế toán, hóa đơn, chứng từ (hạch toán được thuế GTGT đầu vào, đầu ra) và đăng ký tự nguyện áp dụng phương pháp khấu trừ thuế thì đơn vị được áp dụng tính thuế theo phương pháp khấu khấu trừ theo quy định. Đồng thời áp dụng kê khai thuế TNDN theo phương pháp doanh thu - chi phí nếu đơn vị xác định được doanh thu, chi phí, thu nhập của hoạt động kinh doanh. Trường hợp không đáp ứng được các điều kiện để áp dụng tính thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ thì được áp dụng theo phương pháp tính trực tiếp trên GTGT và áp dụng phương pháp tính thuế TNDN trực tiếp nếu đơn vị xác định được doanh thu nhưng không xác định được chi phí, thu nhập của hoạt động kinh doanh. Việc áp dụng tỷ lệ % để tính thuế GTGT, TNDN trên doanh thu được quy định theo từng hoạt động cụ thể nêu trên.

Trường hợp Ban Quản lý dự án Bảo trì đường bộ là đơn vị sự nghiệp công lập, có hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ thì phải nộp lệ phí môn bài theo quy định.

Cục Thuế trả lời để Ban Quản lý dự án Bảo trì đường bộ được biết và căn cứ tình hình hạch toán doanh thu, chi phí thực tế của Ban Quản lý, đối chiếu các quy định của pháp luật để lựa chọn áp dụng phương pháp tính thuế GTGT, thuế TNDN cho phù hợp./.