Công văn 9150/CTKHH-TTHT của Cục Thuế tỉnh Khánh Hòa về tỷ lệ % tính thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập doanh nghiệp theo phương pháp trực tiếp

Kính gửi: Viện Pasteur Nha Trang

Địa chỉ: số 6-8-10 Trần Phú, P. Xương Huân, TP. Nha Trang,
tỉnh Khánh Hòa (MST: 4200288287)

Cục Thuế tỉnh Khánh Hòa (Cục Thuế) nhận được công văn số 2666/IPN-TCKT ghi ngày 05/12/2023 của Viện Pasteur Nha Trang (Viện Pasteur) đề nghị hướng dẫn về thuế suất thuế GTGT, thuế TNDN khi chuyển đổi phương pháp tính thuế khấu trừ sang phương pháp trực tiếp trên doanh thu. Cục Thuế có ý kiến như sau:

Căn cứ khoản 2 Điều 13 Thông tư số 219/2013/TT-BTC (Thông tư số 219/2013/TT-BTC) ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính quy định:

“Điều 13. Phương pháp tính trực tiếp trên giá trị gia tăng

…

2. Số thuế giá trị gia tăng phải nộp theo phương pháp tính trực tiếp trên giá trị gia tăng bằng tỷ lệ % nhân với doanh thu áp dụng như sau:

a) Đối tượng áp dụng:

…

- Tổ chức, cá nhân nước ngoài kinh doanh tại Việt Nam không theo Luật Đầu tư và các tổ chức khác không thực hiện hoặc thực hiện không đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật, trừ các tổ chức, cá nhân nước ngoài cung cấp hàng hóa, dịch vụ để tiến hành hoạt động tìm kiếm, thăm dò, phát triển và khai thác dầu khí.

- Tổ chức kinh tế khác không phải là doanh nghiệp, hợp tác xã, trừ trường hợp đăng ký nộp thuế theo phương pháp khấu trừ.

b) Tỷ lệ % để tính thuế GTGT trên doanh thu được quy định theo từng hoạt động như sau:

- Phân phối, cung cấp hàng hoá: 1%;

- Dịch vụ, xây dựng không bao thầu nguyên vật liệu: 5%;

- Sản xuất, vận tải, dịch vụ có gắn với hàng hoá, xây dựng có bao thầu nguyên vật liệu: 3%;

- Hoạt động kinh doanh khác: 2%.

c) Doanh thu để tính thuế GTGT là tổng số tiền bán hàng hoá, dịch vụ thực tế ghi trên hoá đơn bán hàng đối với hàng hoá, dịch vụ chịu thuế GTGT bao gồm các khoản phụ thu, phí thu thêm mà cơ sở kinh doanh được hưởng.”

Căn cứ khoản 5 Điều 3, khoản 1 Điều 5 Thông tư số 78/2014/TT-BTC (Thông tư số 78/2014/TT-BTC) ngày 18/6/2014 của Bộ Tài chính quy định:

“Điều 3. Phương pháp tính thuế

…

5. Đơn vị sự nghiệp, tổ chức khác không phải là doanh nghiệp thành lập và hoạt động theo quy định của pháp luật Việt Nam, doanh nghiệp nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp trực tiếp có hoạt động kinh doanh hàng hóa, dịch vụ có thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp mà các đơn vị này xác định được doanh thu nhưng không xác định được chi phí, thu nhập của hoạt động kinh doanh thì kê khai nộp thuế thu nhập doanh nghiệp tính theo tỷ lệ % trên doanh thu bán hàng hóa, dịch vụ, cụ thể như sau:

+ Đối với dịch vụ (bao gồm cả lãi tiền gửi, lãi tiền cho vay): 5%.

Riêng hoạt động giáo dục, y tế, biểu diễn nghệ thuật: 2%.

+ Đối với kinh doanh hàng hóa: 1%.

+ Đối với hoạt động khác: 2%

…

Điều 5. Doanh thu

1. Doanh thu để tính thu nhập chịu thuế được xác định như sau:

Doanh thu để tính thu nhập chịu thuế là toàn bộ tiền bán hàng hóa, tiền gia công, tiền cung cấp dịch vụ bao gồm cả khoản trợ giá, phụ thu, phụ trội mà doanh nghiệp được hưởng không phân biệt đã thu được tiền hay chưa thu được tiền.

…

b) Đối với doanh nghiệp nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp trực tiếp trên giá trị gia tăng là doanh thu bao gồm cả thuế giá trị gia tăng.”

Căn cứ các quy định trên, trường hợp Viện Pasteur là đơn vị sự nghiệp không thực hiện hoặc thực hiện không đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật, có hoạt động kinh doanh hàng hóa, dịch vụ có thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp chỉ xác định được doanh thu nhưng không xác định được chi phí, thu nhập của hoạt động kinh doanh thì thực hiện kê khai, nộp thuế như sau:

- Đối với thuế GTGT: Áp dụng phương pháp tính trực tiếp trên giá trị gia tăng, tỷ lệ % để tính thuế GTGT trên doanh thu theo quy định tại khoản 2 Điều 13 Thông tư số 219/2013/TT-BTC.

- Đối với thuế TNDN: Áp dụng phương pháp tính thuế theo tỷ lệ % trên doanh thu, tỷ lệ % trên doanh thu bán hàng hóa, dịch vụ theo quy định tại khoản 5 Điều 3, khoản 1 Điều 5 Thông tư số 78/2014/TT-BTC nêu trên.

Viện Pasteur căn cứ các văn bản pháp luật trích dẫn nêu trên để thực hiện đúng quy định. Nếu có vướng mắc, Viện Pasteur liên hệ Phòng Tuyên truyền hỗ trợ Người nộp thuế để được giải đáp, số điện thoại: 0258-3822028, 0258-3815073./.