Pháp lý doanh nghiệp 
Công văn 6014/CT-KTr được ban hành trên cơ sở đề nghị của Thuế thành phố Đà Nẵng và Công ty TNHH Trùng Phương liên quan đến quản lý thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) đối với các khoản vay có quan hệ liên kết.
Theo khoản 2 Điều 1 Nghị định số 132/2020/NĐ-CP, giao dịch liên kết bao gồm nhiều hình thức như mua bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ, vay - cho vay, bảo lãnh tài chính, chuyển giao tài sản hữu hình, vô hình và các thỏa thuận sử dụng chung nguồn lực giữa các bên có quan hệ liên kết, trừ các giao dịch thuộc phạm vi điều chỉnh giá của Nhà nước.
Đáng chú ý, điểm d khoản 2 Điều 5 Nghị định 132/2020/NĐ-CP xác định quan hệ liên kết trong trường hợp một doanh nghiệp bảo lãnh hoặc cho doanh nghiệp khác vay vốn với điều kiện khoản vay chiếm ít nhất 25% vốn góp của chủ sở hữu và trên 50% tổng nợ trung, dài hạn của doanh nghiệp đi vay.
Theo khoản 3 Điều 16 Nghị định 132/2020/NĐ-CP, tổng chi phí lãi vay được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN không vượt quá 30% ợi nhuận thuần từ hoạt động kinh doanh cộng chi phí lãi vay và khấu hao. Phần chi phí lãi vay không được trừ được phép chuyển sang các kỳ tính thuế tiếp theo nhưng tối đa không quá 05 năm.
Ngày 10/02/2025, Chính phủ ban hành Nghị định số 20/2025/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung một số quy định của Nghị định 132. Theo đó, quy định về quan hệ liên kết tại điểm d khoản 2 Điều 5 được làm rõ hơn, đồng thời loại trừ một số trường hợp vay vốn từ tổ chức tín dụng nếu các bên không có quan hệ điều hành, kiểm soát, góp vốn lẫn nhau.
Đặc biệt, Điều 3 Nghị định 20/2025/NĐ-CP hướng dẫn cách xử lý chi phí lãi vay không được trừ phát sinh trong các năm 2020-2023 kể từ kỳ tính thuế năm 2024, tùy thuộc vào việc doanh nghiệp còn hay không còn quan hệ liên kết.
Căn cứ các quy định nêu trên, Cục Thuế khẳng định không có quy định nào loại trừ doanh nghiệp BOT khỏi phạm vi áp dụng quy định khống chế chi phí lãi vay theo khoản 3 Điều 16 Nghị định 132/2020/NĐ-CP trong giai đoạn từ năm 2020 đến năm 2023. Do đó, kiến nghị của Công ty TNHH Trùng Phương đề nghị loại trừ doanh nghiệp BOT khỏi đối tượng áp dụng là không phù hợp với quy định pháp luật hiện hành.
Cục Thuế đề nghị Thuế thành phố Đà Nẵng căn cứ quy định pháp luật và tình hình thực tế tại doanh nghiệp để hướng dẫn thực hiện đúng quy định về thuế TNDN đối với doanh nghiệp có giao dịch liên kết.
